上海市化工职业病防治院成立于1969年5月，1970年6月正式对外服务。单位成立伊始名称为“上海市化工局职业病防治研究所”，1984年9月更名为“上海市化工职业病防治研究所”。 1998年6月30日依照上海市医疗机构登记管理办法进行补办执业登记，并标准冠名为“上海市化工职业病防治院”。注册地址：上海市成都北路369号。原主管部门：上海华谊（集团）公司。 2006年4月本院由上海华谊（集团）公司整建制划归上海市安全生产监督管理局管理，成为上海市安全生产监督管理局的直属单位之一，具备安全领域和职业卫生领域的服务资质、同时具备职业安全卫生评价、检测、诊断、体检、救治、化学品信息咨询等全面综合服务能力。 是上海市卫生局批准的从事职业病防治工作的专门机构。
       本院设有化学事故应急救援办公室、职业病科、健康体检科、职业安全卫生检测与评价中心、上海化学毒物咨询中心、化学品专业知识培训部、《职业卫生与应急救援》杂志编辑部、上海天麟安全管理咨询有限公司等业务机构。 政府在本院设置的机构有上海市化学品登记注册办公室等。 目前本院有专业技术人员108人，其中高级职称15人，中级职称46人。 本院主要开展职业病危害事故及突发性化学中毒事故的调查处理、职业性健康检查和评价、职业病门诊、职业病临床诊断与治疗、职业流行病学调查研究、中毒事故应急救援、化学毒物信息咨询、化学品专业知识培训、建设项目或生产经营单位安全评价、建设项目职业卫生评价、工作场所职业病危害因素检测与评价、职业病防治技术指导工作等。
       近5年本院参加化学事故医疗抢救市内外会诊50余次、应急救援出动13次。 主要有：2002年3月27日上海宝山仓库燃爆事故；2002年7月19日上海有机锡中毒事故；2003年11月28日嘉定区某化工厂氯气泄漏事故；2003年12月23日重庆开县天然气井喷特大事故；2004年4月17日重庆天原化工总厂氯气泄漏爆炸事故； 2004年8月2日上海延安东路隧道氧化锌烟雾扩散事故；2005年沪宁高速公路江苏淮安段氯气泄漏事故、上海南汇氨罐泄漏事故；2006年四川九寨沟甲苯二异氰酸酯泄漏事故、汉宜高速公路硫酸二甲酯泄漏事故等。